155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1251 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  78.37 
 
 		 248 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  57.27 
 
 		 223 aa  268  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  54.85 
 
 		 258 aa  255  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  54.43 
 
 		 258 aa  252  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  53.91 
 
 		 244 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  51.45 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  50.41 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  47.68 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  54.37 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  45.42 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  43.6 
 
 		 342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  43.4 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  43.4 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  43.4 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  43.4 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  38.91 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  43.4 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  41.47 
 
 		 251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  43.87 
 
 		 237 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  37.69 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  40.53 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  40.47 
 
 		 237 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  40.47 
 
 		 347 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  43.32 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  39.53 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  40 
 
 		 347 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  38.15 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  40 
 
 		 237 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  39.53 
 
 		 237 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  40.27 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  39.81 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  37.38 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  39.42 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  37.56 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  36.97 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  38.39 
 
 		 240 aa  119  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  33.95 
 
 		 228 aa  115  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  34.13 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  32.74 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  33.06 
 
 		 246 aa  101  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  31.82 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  30.43 
 
 		 251 aa  98.6  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  30.64 
 
 		 333 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  32.14 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  29.36 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  31 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  30.36 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  29.52 
 
 		 254 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  31.25 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  30.26 
 
 		 242 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  29.52 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  29.52 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  29.52 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  29.63 
 
 		 242 aa  85.9  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  30.3 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  32.31 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  26.57 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  32.5 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  26.67 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  37.62 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3796  hypothetical protein  29.41 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  29.79 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3995  hypothetical protein  30.36 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  30.92 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  31.05 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  32.37 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  27.9 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  26.55 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  32.66 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4611  hypothetical protein  27.2 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  26.03 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  28.09 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  29.03 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  25.99 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  26.5 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  29.07 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  32.57 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  23.11 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  23.93 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  27.48 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  26.86 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  27.83 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  25.96 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  29.15 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  29.2 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  26.61 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  31.82 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  29.49 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  26.52 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  25.1 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  25.51 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  30.16 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  29.02 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  35.77 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  26.88 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  32.53 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  27.67 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  31.48 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>