164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21810 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  621  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  57.25 
 
 		 294 aa  276  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  41.48 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  51.29 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  41.97 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  35.6 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  35.51 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  37.39 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  37.99 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  38.43 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  36.39 
 
 		 348 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  36.99 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  37.13 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  36.21 
 
 		 256 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  33.61 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  30.67 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  34.8 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  34.77 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  32.88 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  33.47 
 
 		 271 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  31.8 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  33.19 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  34.58 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  33.61 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  34.82 
 
 		 271 aa  99  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  31.64 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  31.62 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  32.23 
 
 		 270 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  32.23 
 
 		 270 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  31.62 
 
 		 280 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  32.23 
 
 		 270 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  33.48 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  32.77 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  33.21 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  32.59 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  30.8 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  30.37 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  34.75 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  30.97 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  29.96 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  30.93 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  30.08 
 
 		 237 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  29.24 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  28.74 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  30.6 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  28.33 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  29.73 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  28.69 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  28.51 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  31.91 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  30.77 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.84 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.93 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  26.32 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  32.11 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  31.06 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  27.24 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  29.15 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  28.68 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  27.8 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  27.92 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  29.02 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  27.8 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  28.63 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  27.8 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  27.8 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  27.8 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  26.61 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  30.29 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  31.5 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  29.51 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  28.21 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  27.7 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  27.39 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  29.53 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  27.92 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  30.25 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  28.4 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  30 
 
 		 250 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  29.15 
 
 		 243 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  32.84 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  28.44 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  27.34 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.31 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  31.17 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  30.28 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  30.19 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07660  hypothetical protein  31.52 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66044  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  27.04 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  28.46 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  28.69 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.32 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  30.04 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.81 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  34.97 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  29.05 
 
 		 249 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  35.38 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  26.41 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  36.94 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>