134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1413 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  570  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  52.27 
 
 
314 aa  281  8.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  40.53 
 
 
303 aa  211  9e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  48.71 
 
 
301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  42.67 
 
 
305 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  38.31 
 
 
288 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  36.43 
 
 
290 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  41.46 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  40.81 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  35.69 
 
 
302 aa  132  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  32.67 
 
 
304 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  35.91 
 
 
348 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  32.66 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  31.8 
 
 
301 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  34.19 
 
 
324 aa  106  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  34.47 
 
 
280 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  31.71 
 
 
303 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  36.84 
 
 
271 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  35.47 
 
 
256 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  33.05 
 
 
264 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  31.4 
 
 
292 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  36 
 
 
279 aa  99  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  37.3 
 
 
294 aa  99  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  38.04 
 
 
271 aa  99  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  34.56 
 
 
270 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  34.56 
 
 
270 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  34.56 
 
 
270 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  32.93 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  30.31 
 
 
276 aa  92.4  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  33.88 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  32.37 
 
 
245 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  33.59 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  29.49 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  29.1 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  30.51 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  29.23 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  29.23 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  31.52 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  28.96 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  30.87 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  29.1 
 
 
253 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  31.46 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  29.66 
 
 
254 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  30.77 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  27.6 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  28.76 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  30.2 
 
 
246 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  29.11 
 
 
243 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  29.2 
 
 
245 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  37.23 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  31.03 
 
 
233 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  28.78 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  28.63 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  27.94 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  28.17 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  28.24 
 
 
249 aa  56.2  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  32.06 
 
 
342 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  27.86 
 
 
249 aa  56.2  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  26.56 
 
 
298 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  32.48 
 
 
230 aa  55.8  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  28.47 
 
 
256 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  32.54 
 
 
238 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  31.41 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.82 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  30.77 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  28.46 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  30.77 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  30.77 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  30.77 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  28.21 
 
 
255 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  28.37 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  32.31 
 
 
237 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  29.1 
 
 
347 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  32.04 
 
 
252 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  28.52 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  29.1 
 
 
237 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.42 
 
 
248 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  30 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  27.66 
 
 
237 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  34.9 
 
 
256 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  28.17 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  28.98 
 
 
234 aa  53.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  25 
 
 
250 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  30.9 
 
 
223 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  32.03 
 
 
283 aa  52.8  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  26.24 
 
 
243 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  29.88 
 
 
223 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  29.88 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  26.61 
 
 
228 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  29.84 
 
 
256 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  56.36 
 
 
249 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  27.42 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.51 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  30.24 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  37.5 
 
 
229 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  25.53 
 
 
347 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  30.16 
 
 
237 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  29.48 
 
 
269 aa  50.4  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.35 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  29.48 
 
 
269 aa  50.4  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>