152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0320 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  100 
 
 		 251 aa  494  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  72.2 
 
 		 272 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  54.07 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  52.17 
 
 		 256 aa  252  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  51.38 
 
 		 256 aa  248  8e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  43.4 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  42.74 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  44.84 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  44.84 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  44.39 
 
 		 347 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  44.39 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  44.39 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  44.39 
 
 		 236 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  43.5 
 
 		 243 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  43.67 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  43.52 
 
 		 237 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  41.84 
 
 		 342 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  41.84 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  41.84 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  41.84 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  41.84 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  41.84 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  41.81 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  41.38 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  41.47 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  40.52 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  40.69 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  40.09 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  34.68 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  38.57 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  37.02 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  35 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  36.48 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  35.42 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  37.4 
 
 		 295 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  37.5 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  41.01 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  34.76 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  31.09 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  37.44 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  30.64 
 
 		 272 aa  92.8  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  31.36 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  29.39 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  30.2 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  24.79 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  28.74 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  24.79 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  29.3 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  36.12 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  32.07 
 
 		 247 aa  85.5  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  27.57 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  33.03 
 
 		 245 aa  85.1  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  32.16 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  26.16 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  34.29 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  32.07 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  30.93 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  26.16 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  30.67 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  26.16 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  26.16 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  31.65 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  29.08 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  32.26 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  27.31 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  30.8 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  27.04 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  28.05 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  30.13 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  25.62 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3796  hypothetical protein  27.24 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  26.19 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3995  hypothetical protein  27.64 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  30.71 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  34.69 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  31.8 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  29.74 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  29.27 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  32.77 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  33.75 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  30.93 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  28.63 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  24.89 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  28.33 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  24.81 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  31.49 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  29.05 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0645  hypothetical protein  31.08 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  0.230839 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  27.14 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  30.56 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  28.63 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  25.64 
 
 		 288 aa  62  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  25.83 
 
 		 308 aa  62  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4611  hypothetical protein  26.92 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  25.4 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  25.53 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  28.57 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  28.99 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  29.34 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  32.38 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>