154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3452 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  88.28 
 
 		 256 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  89.06 
 
 		 256 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  71.31 
 
 		 253 aa  355  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  73.03 
 
 		 253 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  68.55 
 
 		 254 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  51.09 
 
 		 261 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  48.8 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  46.01 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  47.84 
 
 		 233 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  47.3 
 
 		 281 aa  184  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  44.65 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  44.94 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  44.53 
 
 		 253 aa  178  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  45.15 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  47.25 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  45.83 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  43.78 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  44.13 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  45.11 
 
 		 278 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  46 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  39.52 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  44.34 
 
 		 229 aa  165  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  46.12 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  41.06 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  41.06 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  39.74 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  38.33 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  40.52 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  42.47 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  39.55 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  43.12 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  36.07 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  42.79 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  38.25 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  38.2 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  39.18 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  44.93 
 
 		 231 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  36.64 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  42.47 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  35.92 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  40.65 
 
 		 230 aa  128  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  38.19 
 
 		 282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  31.98 
 
 		 268 aa  127  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  36.09 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  36.02 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  29.62 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  35.22 
 
 		 269 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  35.59 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  35.71 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  36.49 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  34.27 
 
 		 324 aa  108  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  34.03 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  33.9 
 
 		 223 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  33.9 
 
 		 223 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  95.9  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  29.54 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  29.52 
 
 		 238 aa  85.9  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  28.87 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  30 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  28.87 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  29.91 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  31.34 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  28.4 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  33.19 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  35.44 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  28.45 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  34.18 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  34.18 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  34.18 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  34.18 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  34.16 
 
 		 342 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  28.03 
 
 		 237 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  28.03 
 
 		 237 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  30.49 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  22.8 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  30.42 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  31.05 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00150  mitochondrial protein required for respiration, putative  29.8 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303199  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  22.04 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  37.5 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  30.36 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  30.7 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.44 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  30.65 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  23.85 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  28.97 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  30.61 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  27.94 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  27.6 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  28.97 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  26.16 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  28.57 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  24.75 
 
 		 359 aa  58.5  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  32.17 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  27.63 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  26.05 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  28.47 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.98 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>