141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1830 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  100 
 
 		 223 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  99.55 
 
 		 223 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  91.03 
 
 		 223 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  61.19 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  54.05 
 
 		 223 aa  243  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  53.33 
 
 		 224 aa  224  6e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  51.82 
 
 		 220 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  35.09 
 
 		 264 aa  111  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  36.68 
 
 		 249 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  34.02 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  36.68 
 
 		 249 aa  108  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  37.44 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  35.06 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  33.19 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  33.47 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  38.6 
 
 		 230 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  32.42 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  34.2 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  33.76 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  33.77 
 
 		 253 aa  101  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  33.75 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  30.22 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  29.55 
 
 		 268 aa  99.4  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  35.17 
 
 		 253 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  33.9 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  33.76 
 
 		 250 aa  98.6  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  33.77 
 
 		 250 aa  98.2  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  33.18 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  33.61 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  35.32 
 
 		 254 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  33.95 
 
 		 278 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  35.15 
 
 		 260 aa  95.9  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  32.37 
 
 		 263 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  32.89 
 
 		 244 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  32.61 
 
 		 261 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  33.8 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  32.55 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  34.98 
 
 		 267 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  28.37 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  32.89 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  30.7 
 
 		 269 aa  87.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  33.5 
 
 		 281 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  30.26 
 
 		 269 aa  85.9  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  33.88 
 
 		 259 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  29.24 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  29.91 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  33.81 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  31.67 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  35.27 
 
 		 247 aa  78.2  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  28.69 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  33.85 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  30.49 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  31.63 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  30.99 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  32.32 
 
 		 250 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  28.57 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  27.36 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  29.44 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  28.64 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  29.44 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2227  SURF1 family protein  31.39 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.752396  normal  0.0142027 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  29.28 
 
 		 243 aa  72  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  28.97 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.25 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  31.47 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  28.02 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  25.25 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  31.82 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  30.09 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  29.03 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3882  hypothetical protein  31.22 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  30.04 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  30.23 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  30.25 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  29.65 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  28.64 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1248  hypothetical protein  23.87 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  30.05 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  31.28 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  32.09 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  25.52 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  31.58 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.44 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  29.09 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  25.52 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  28.04 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  27.62 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  28.11 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  27.11 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  27.27 
 
 		 314 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  31.63 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  31.82 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  27.62 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  27.62 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  27.62 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  27.62 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  27.63 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  27.35 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  26.18 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  27.66 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>