52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2227 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2227  SURF1 family protein  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.752396  normal  0.0142027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  32.08 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  31.39 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  31.31 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  31.39 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  31.39 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  32 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  29.82 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  31.2 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  28.27 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  28.96 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  27.27 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  32.43 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  31.98 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  25.93 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  26.56 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  28.63 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  31.16 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  29.95 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  28.7 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  40.22 
 
 		 260 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  30.37 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  27.62 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  38.27 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  29.22 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  28.22 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  28.05 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  25.32 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  27.46 
 
 		 267 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  27.97 
 
 		 249 aa  48.5  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  27.95 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  25 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  28.18 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  24.63 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  27.12 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  28.37 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  26.69 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  25.12 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  26.91 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  27.34 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  35.44 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  26.15 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  24.65 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  36.26 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  27.71 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  25.52 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  31.4 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  38.64 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  23.18 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  25.94 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  24.89 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  21.61 
 
 		 268 aa  42  0.008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>