77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0835 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  65.83 
 
 		 249 aa  327  8e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  64.57 
 
 		 259 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  64.05 
 
 		 259 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  63.71 
 
 		 268 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  60.16 
 
 		 250 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  61.83 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  37.45 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  33.03 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  30.77 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  33.47 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  33.47 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  34.16 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  30.74 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  33.77 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  37.25 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  31.36 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  33.63 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  35.5 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  34.18 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  35.44 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  32.33 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  35.12 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  29.07 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  33.64 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  32.88 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  31.36 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  37.99 
 
 		 230 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  34.47 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  32.56 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  35.59 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  31.74 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  30.59 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  31.12 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  32.75 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  35.02 
 
 		 237 aa  89  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  27.42 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  27.42 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  28.97 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  28.09 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  30.74 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  27.27 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  26.86 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  27.66 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  29.11 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  25.52 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  31.58 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  25.42 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  29.83 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  30.36 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  29.6 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  29.74 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  28.57 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  30.33 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  28.81 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  28.81 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  29.24 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  27.17 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  28.44 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00150  mitochondrial protein required for respiration, putative  29.08 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  27.38 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  24 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  28.05 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  22.89 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  27.5 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  23.65 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  25.81 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  24.1 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  24.18 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  23.87 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2227  SURF1 family protein  25.42 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.752396  normal  0.0142027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  26.25 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  22.13 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.07 
 
 		 258 aa  42.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.07 
 
 		 258 aa  42  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  24.9 
 
 		 294 aa  42  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  23.77 
 
 		 256 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>