131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2269 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  100 
 
 		 269 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  99.26 
 
 		 269 aa  533  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  61.6 
 
 		 282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  62.66 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  56.15 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  48.62 
 
 		 278 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  50.21 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  48.37 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  44.31 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  50.21 
 
 		 229 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  43.92 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  53.24 
 
 		 285 aa  194  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  50 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  45.8 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  52.52 
 
 		 281 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  48.59 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  53.67 
 
 		 287 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  49.3 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  43.8 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  50.7 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  52.11 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  45.74 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  38.68 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  51.58 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  37.7 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  38.39 
 
 		 247 aa  128  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  36.6 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  36.99 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  36.95 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  36.32 
 
 		 256 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  36.18 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  35.77 
 
 		 249 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  34.04 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  34.52 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  33.2 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  34.16 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  35.29 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  34.4 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  33.47 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  34.02 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  32.63 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  31.98 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  31.85 
 
 		 250 aa  109  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  33.33 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  38.22 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  33.04 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  35.09 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  33.89 
 
 		 244 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  34.04 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  32.03 
 
 		 223 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  30.59 
 
 		 233 aa  90.5  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  30.3 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  30.3 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  27.13 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  30.4 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  28.28 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  28.16 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  30.83 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  27.31 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00150  mitochondrial protein required for respiration, putative  25.87 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  28.98 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  29.37 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  39.23 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  25.8 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  26.18 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  29.74 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  28.22 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  31.02 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  28.63 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  29.95 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  32.2 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  31.55 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  31.4 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  28 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  31.55 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  28.4 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  30.51 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  27.71 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  33.64 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.39 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  27.8 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  29.59 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.17 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  33.64 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  33.64 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  33.64 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  33.64 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  29.62 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  30.48 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  35 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  27.75 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  27.86 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  34.27 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  29.59 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  29.1 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  29.88 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  29.44 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  23.5 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  29.95 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>