147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5989 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  100 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  84.77 
 
 		 263 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  63.76 
 
 		 251 aa  285  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  56.9 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  62.61 
 
 		 261 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  51.87 
 
 		 252 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  53.19 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  53.19 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  54.88 
 
 		 278 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  61 
 
 		 233 aa  250  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  54.63 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  61.68 
 
 		 281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  56.05 
 
 		 244 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  56.17 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  61.54 
 
 		 287 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  55.41 
 
 		 229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  63.64 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  56.4 
 
 		 285 aa  211  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  46.28 
 
 		 269 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  46.28 
 
 		 269 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  48.74 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  44.73 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  54.93 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  48.26 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  50.23 
 
 		 237 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  44.67 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  45.99 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  48.4 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  48.61 
 
 		 264 aa  191  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  45.18 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  44.05 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  42.11 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  42.73 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  47.91 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  42.4 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  43.75 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  44.34 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  43.78 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  41.31 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  38.11 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  40.52 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  44.6 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  37.04 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  37.86 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  39.2 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  36.63 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  37.9 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  36.99 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  35.5 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  35.81 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  34.84 
 
 		 324 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  32.33 
 
 		 223 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  32.33 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  32.48 
 
 		 224 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  30.84 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  30.57 
 
 		 223 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  30.94 
 
 		 233 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  31.14 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  31.22 
 
 		 246 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  26.47 
 
 		 359 aa  85.1  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00150  mitochondrial protein required for respiration, putative  27.2 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303199  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  26.58 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  28.69 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  30.17 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  27.91 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  28.33 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  31.8 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_002978  WD1248  hypothetical protein  26.61 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  28.51 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  31.09 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  29.15 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  27.08 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  28.34 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  25.55 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.25 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  28.25 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  29.32 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.83 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  30.52 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  29.74 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  29.65 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  26.72 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  35.14 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  26.5 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  27.35 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  27.27 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  27.35 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  27.78 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  27.78 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  27.78 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  27.78 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  27.78 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  26.56 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  26.56 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  26.56 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  27.8 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  23.45 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  29.33 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  29.6 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  26.92 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>