145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4850 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  100 
 
 		 233 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  86.67 
 
 		 244 aa  368  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  86.36 
 
 		 229 aa  358  5e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  62.67 
 
 		 278 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  67.28 
 
 		 281 aa  264  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  66.36 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  60.36 
 
 		 278 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  64.93 
 
 		 233 aa  258  8e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  53.1 
 
 		 250 aa  251  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  56.22 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  55.26 
 
 		 253 aa  244  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  55.26 
 
 		 253 aa  244  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  59.72 
 
 		 251 aa  241  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  53.51 
 
 		 252 aa  232  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  63.26 
 
 		 285 aa  231  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  57.14 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  56.71 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  57.82 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  59.43 
 
 		 287 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  54.24 
 
 		 237 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  63.82 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  51.63 
 
 		 282 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  47.84 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  56.4 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  48.9 
 
 		 253 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  46.46 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  46.67 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  41.48 
 
 		 268 aa  181  6e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  46.22 
 
 		 256 aa  181  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  47.32 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  44.2 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  45.33 
 
 		 249 aa  171  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  45.33 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  41.85 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  42.66 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  39.37 
 
 		 250 aa  151  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  43.06 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  40.28 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  40.52 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  37.9 
 
 		 241 aa  138  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  39.27 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  35.96 
 
 		 259 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  38.94 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  42.29 
 
 		 247 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  35.4 
 
 		 268 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  35.17 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  37.17 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  32.44 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  33.19 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  33.33 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  33.19 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  33.19 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  32.3 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  32.27 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  32.89 
 
 		 224 aa  99  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  28.38 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00150  mitochondrial protein required for respiration, putative  29.37 
 
 		 335 aa  88.2  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303199  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  30.32 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  30.13 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  31.28 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  42.22 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  34.75 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  39.57 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  24.46 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  29.29 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  28.14 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  30.84 
 
 		 288 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  29.2 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  29.73 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  30.57 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  35.04 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  35.04 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  35.04 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  35.04 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  35.04 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  27.44 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  31.47 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  35.04 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  29.55 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  22.69 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  29.47 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  29.74 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  33.18 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  34.31 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  27.43 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  27.91 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  22.69 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  30 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  31.03 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  35.11 
 
 		 347 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  33.59 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  28.25 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  23.04 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  32.53 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  27.62 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  34.06 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  27.62 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  27.62 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  33.59 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  30 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>