83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI00150 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006694  CNI00150  mitochondrial protein required for respiration, putative  100 
 
 		 335 aa  673    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303199  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  32.78 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  31.47 
 
 		 229 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  29.37 
 
 		 233 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  29.8 
 
 		 261 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  30.66 
 
 		 246 aa  89.4  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  31.32 
 
 		 244 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  31.62 
 
 		 281 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  27.82 
 
 		 250 aa  85.9  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  28.51 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  24.92 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  29.13 
 
 		 252 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  30.74 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  28.51 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  28.51 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  28.52 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  28.46 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  30.04 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  29.5 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  29.34 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  28.88 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  26.45 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  30.04 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  30.04 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  27.17 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  28.1 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  27.17 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  29.41 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  25.63 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  28.57 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  25.95 
 
 		 269 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  25.95 
 
 		 269 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  28.63 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  27.34 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  29.34 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  29.88 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  28.29 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  28.76 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  25.52 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  28.08 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  29.96 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  28.63 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  27.87 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  29.33 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  27.23 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  26.21 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  28.41 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  28.02 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  25.76 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  25.48 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  26.86 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  29.15 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  26.94 
 
 		 220 aa  57  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  28.17 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  27.17 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  25.86 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  25.98 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  27.17 
 
 		 223 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  26.88 
 
 		 213 aa  53.9  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  22.73 
 
 		 228 aa  53.1  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  27.86 
 
 		 223 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  24.9 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  27.5 
 
 		 238 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  23.75 
 
 		 210 aa  49.3  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  29.6 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  28.66 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  28.68 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  28.8 
 
 		 243 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  28.66 
 
 		 237 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  22.41 
 
 		 208 aa  46.2  0.0009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  28.66 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1248  hypothetical protein  22.53 
 
 		 205 aa  45.8  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  27.55 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  27.1 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  26.53 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  26.53 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  26.53 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  26.72 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  26.83 
 
 		 264 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  26.75 
 
 		 237 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  24.89 
 
 		 247 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  29 
 
 		 243 aa  42.7  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  32.04 
 
 		 222 aa  42.7  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>