119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15930 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  691    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  41.56 
 
 		 301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  35.76 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  38.98 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  39.34 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  38.46 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  38.89 
 
 		 294 aa  133  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  37.39 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  34.12 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  36.12 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  34.18 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  35.8 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  36.47 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  35.98 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  31.33 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  35.19 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  32.25 
 
 		 280 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  33.61 
 
 		 271 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  34.14 
 
 		 272 aa  92.4  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  33.19 
 
 		 256 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  31.58 
 
 		 270 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  31.58 
 
 		 270 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  31.58 
 
 		 270 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  30.87 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  29.8 
 
 		 292 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  30.43 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  29.36 
 
 		 294 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  31.44 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  31.3 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  33.45 
 
 		 271 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  31.56 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  28.57 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  29.13 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  28.17 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  27.43 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  24.68 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  27.35 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  26.55 
 
 		 238 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  33.58 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  28.57 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  30.45 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  25 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  29.91 
 
 		 224 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  25.41 
 
 		 255 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  26.72 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  30.23 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  25.22 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  27.11 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  29.07 
 
 		 276 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  26.12 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.35 
 
 		 246 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  24.78 
 
 		 237 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  25.99 
 
 		 237 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  28.77 
 
 		 242 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  27.15 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  31.15 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  30.7 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  25 
 
 		 253 aa  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  25 
 
 		 253 aa  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  27.39 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  28.38 
 
 		 236 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  25.91 
 
 		 250 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  27.5 
 
 		 220 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  26.7 
 
 		 252 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.42 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  25.88 
 
 		 245 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  25.97 
 
 		 250 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  26 
 
 		 223 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  30.18 
 
 		 311 aa  49.3  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  28.89 
 
 		 237 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  27.27 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  24.9 
 
 		 248 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  26 
 
 		 223 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  30.26 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  31.14 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  26.07 
 
 		 229 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  29.27 
 
 		 246 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  30.07 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  28.89 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  28.89 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  28.89 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  28.89 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  28.89 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  26.43 
 
 		 244 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  30.82 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  28.89 
 
 		 259 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  30.59 
 
 		 223 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  26.09 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  22.75 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  27.1 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07660  hypothetical protein  28.57 
 
 		 284 aa  47.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66044  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  26.38 
 
 		 250 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  30.95 
 
 		 283 aa  47  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  31.97 
 
 		 261 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  23.53 
 
 		 254 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  27.39 
 
 		 243 aa  46.6  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  26.39 
 
 		 234 aa  46.2  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  26.07 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>