97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0906 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  100 
 
 		 267 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  69.32 
 
 		 268 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  67.32 
 
 		 259 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  65.34 
 
 		 259 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  62.96 
 
 		 249 aa  315  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  61.6 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  61.83 
 
 		 251 aa  288  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  38.17 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  37.4 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  39.58 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  38.17 
 
 		 256 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  35.43 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  34.54 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  36.05 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  35.17 
 
 		 233 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  33.61 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  33.2 
 
 		 253 aa  122  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  33.2 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  31.93 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  37.96 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  38.7 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  36.36 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  34.6 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  35.59 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  31.38 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  36.73 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  34.91 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  33.06 
 
 		 250 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  37.84 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  38.46 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  33.33 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  32.92 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  33.64 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  37.39 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  35.08 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  32.24 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  36.08 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  30.21 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  29.18 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  30.68 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  37.33 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  36.99 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  35.53 
 
 		 223 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  29.76 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  29.37 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  32.46 
 
 		 237 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  29.64 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  33.04 
 
 		 285 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  34.22 
 
 		 223 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  34.98 
 
 		 223 aa  89  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  34.98 
 
 		 223 aa  89  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  31.22 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  30.08 
 
 		 220 aa  85.9  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  31.53 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  32.55 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  29.55 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  31.66 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  28.74 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  28.52 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00150  mitochondrial protein required for respiration, putative  25.38 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  28.17 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  28.05 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  29.44 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  21.3 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  27 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  19.57 
 
 		 210 aa  53.5  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  28.79 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  30 
 
 		 237 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  30 
 
 		 342 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  33.06 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.91 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2227  SURF1 family protein  27.46 
 
 		 237 aa  48.9  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.752396  normal  0.0142027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.91 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  29.05 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1399  SurF1 family protein  27.97 
 
 		 188 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  29.27 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  29.23 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  21.67 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  27.5 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  26.53 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  29.85 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  27.16 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  29.27 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  27.42 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  22.27 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  28.33 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  27.05 
 
 		 324 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  30.8 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  28.33 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.23 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  23.9 
 
 		 256 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>