134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1735 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  100 
 
 		 261 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  61.16 
 
 		 263 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  66.36 
 
 		 233 aa  278  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  65.7 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  58.37 
 
 		 253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  58.78 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  56.33 
 
 		 252 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  69.19 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  67.38 
 
 		 281 aa  265  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  57.85 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  62.61 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  66.06 
 
 		 244 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  64.93 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  66.82 
 
 		 229 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  63.9 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  63.46 
 
 		 278 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  62.91 
 
 		 285 aa  238  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  71.57 
 
 		 231 aa  231  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  55.42 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  51.09 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  54.63 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  50.45 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  57.47 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  49.55 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  49.77 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  50.68 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  50.68 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  54.89 
 
 		 282 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  48.73 
 
 		 269 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  46.64 
 
 		 264 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  49.56 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  48.31 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  44.26 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  48.42 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  48.6 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  44.6 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  42.65 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  43.46 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  40.98 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  41.45 
 
 		 244 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  47.44 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  41.63 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  40.91 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  37.19 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  37.19 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  33.04 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  35.04 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  34.36 
 
 		 249 aa  112  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  34.84 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  33.62 
 
 		 268 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  32.14 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  32.61 
 
 		 223 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  32.61 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  32.61 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  32.56 
 
 		 233 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  31.88 
 
 		 223 aa  95.5  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  33.77 
 
 		 224 aa  92.4  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00150  mitochondrial protein required for respiration, putative  29.27 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303199  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  30.43 
 
 		 220 aa  89.7  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  30.8 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  33.76 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  34.5 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  27.4 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  32.07 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  29.05 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  28.64 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1248  hypothetical protein  27.31 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  28.11 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  31 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  31.05 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  26.17 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  32.63 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  22.71 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2227  SURF1 family protein  31.74 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.752396  normal  0.0142027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  27.27 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  37.01 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  22.77 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  29.75 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  25.86 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  28.51 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  37.39 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  27.93 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  29.67 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  30.66 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  29.68 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  30.28 
 
 		 265 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  29.17 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  27.75 
 
 		 292 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  28.77 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  28.31 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  34.25 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  28.24 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  33.01 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  29.06 
 
 		 294 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  32.38 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  31.82 
 
 		 342 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  32.58 
 
 		 237 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  32.58 
 
 		 237 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  32.58 
 
 		 237 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  32.58 
 
 		 237 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>