187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4071 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  82.38 
 
 		 246 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  41.46 
 
 		 248 aa  141  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  35.63 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  31.56 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  37.83 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  29.88 
 
 		 288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  31.15 
 
 		 303 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  35.59 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  34.62 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  33.98 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  29.95 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  34 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.64 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  33.8 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  31.84 
 
 		 237 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  35.92 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  35.89 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  32.89 
 
 		 271 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  31.39 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  31.86 
 
 		 255 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  34.84 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  31.67 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  31.39 
 
 		 347 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  31.84 
 
 		 347 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  31.9 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.47 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  31.39 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  29.34 
 
 		 238 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  31.05 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  31.05 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  31.05 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  31.05 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  30.94 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  28.17 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  30.59 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  30.77 
 
 		 342 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  35.37 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  31.51 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  30.26 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  32.37 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  32.74 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  34.62 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  32.3 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.58 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  29.87 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  31.43 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  29.08 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  32.6 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  32.34 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  29.3 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  30.22 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  32.02 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  32.74 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  28.86 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  28.27 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  29.33 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.54 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  32.59 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  31.28 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  33.33 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.13 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  32.91 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  27.64 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  29.3 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  28.75 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  31.53 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  28.51 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  30.8 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  30.71 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  32.31 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  31.47 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  30.68 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  32.46 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  29.15 
 
 		 249 aa  72  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  27.95 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  27.95 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  30.29 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  30.49 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  29.57 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  30.13 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  29.29 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  33.86 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  30.83 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  31.47 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  32.75 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  30.51 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  30.83 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  29.44 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  29.91 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  30.58 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  31.47 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  27.93 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  30.6 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  30.04 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  30.04 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  30.04 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  30 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>