147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0474 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  100 
 
 		 249 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  99.6 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  82.8 
 
 		 264 aa  424  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  57.83 
 
 		 250 aa  294  7e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  59.92 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  59.72 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  58.8 
 
 		 241 aa  261  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  59.09 
 
 		 250 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  47.87 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  50.68 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  44.86 
 
 		 260 aa  178  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  48 
 
 		 250 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  42.17 
 
 		 253 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  45.33 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  44.4 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  41.94 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  48.11 
 
 		 281 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  41.13 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  38.74 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  41.06 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  44.75 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  43.89 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  42.67 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  41.26 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  41.26 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  38.3 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  44.88 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  42.24 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  43.9 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  41.7 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  43.14 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  34.15 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  43.35 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  38.59 
 
 		 246 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  37.5 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  39.47 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  40.35 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  33.59 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  36 
 
 		 247 aa  121  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  40.28 
 
 		 285 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  36.8 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  36.8 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  37.5 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  36.68 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  36.68 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  32.4 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  34.07 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  35.05 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  30.74 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  33.47 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  33.05 
 
 		 224 aa  99  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  32.31 
 
 		 220 aa  99  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  32.92 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  29.76 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  31.05 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  29.24 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  32.14 
 
 		 243 aa  92.4  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  28 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  31.49 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  29.3 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  26.81 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.12 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00150  mitochondrial protein required for respiration, putative  27.17 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  27.27 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  30.83 
 
 		 246 aa  72  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.72 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  30.13 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  29.1 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  28.26 
 
 		 347 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  27.49 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  28.26 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  23.48 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  23.04 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  30.29 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  28.7 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  30.9 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  30.9 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  30.9 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  30.9 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  27.59 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  30.9 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  27.85 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  27.39 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  31.11 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  28.25 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  29.18 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  29.56 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  25.51 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  36.22 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  26.91 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  36.36 
 
 		 244 aa  62  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  30.34 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  27.66 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2227  SURF1 family protein  32.43 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.752396  normal  0.0142027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  28.7 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  30.97 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  29.3 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.25 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1248  hypothetical protein  29.81 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.17 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>