130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5731 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  100 
 
 		 231 aa  441  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  63.26 
 
 		 233 aa  242  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  70.1 
 
 		 261 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  64.59 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  59.61 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  60.8 
 
 		 263 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  67.31 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  64.08 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  60.87 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  64 
 
 		 229 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  61.62 
 
 		 251 aa  228  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  62.94 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  53.66 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  64.21 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  63.5 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  55.1 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  57.47 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  54.08 
 
 		 253 aa  208  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  54.08 
 
 		 253 aa  208  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  56.7 
 
 		 282 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  52.58 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  60.1 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  52.11 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  45.37 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  46.51 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  46.34 
 
 		 254 aa  158  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  46.73 
 
 		 253 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  44.55 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  48.79 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  42.92 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  43.54 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  43.75 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  42.65 
 
 		 256 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  40.47 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  41.75 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  41.55 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  41.83 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  40 
 
 		 250 aa  128  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  45.37 
 
 		 247 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  37.19 
 
 		 241 aa  124  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  40.19 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  38.24 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  39.91 
 
 		 244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  34.6 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  35.29 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  35.48 
 
 		 259 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  34.74 
 
 		 268 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  33.02 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  36.27 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  32.87 
 
 		 267 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  33.83 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  33.83 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  32.08 
 
 		 324 aa  90.5  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  31.58 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  32.08 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  30.15 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  34.13 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  31.46 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  32.86 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  30.63 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00150  mitochondrial protein required for respiration, putative  29.26 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303199  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  35.37 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  29.86 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.48 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  31.2 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  28.34 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  28.34 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  28.34 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  28.34 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  28.34 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  29.68 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  27.81 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  28.9 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  29.28 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  28.04 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  28.04 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  28.04 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  37.6 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  33.59 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  29.07 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  29.44 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  27.85 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  32.13 
 
 		 283 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  28.41 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  29.7 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  29.55 
 
 		 347 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  27.61 
 
 		 359 aa  52.8  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  31.65 
 
 		 324 aa  52.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  29.22 
 
 		 292 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  28.94 
 
 		 223 aa  52  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  26 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  30.17 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  29.55 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  33.05 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  23.72 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  24.64 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  29.15 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  27.86 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  29.55 
 
 		 347 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  30 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>