180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6170 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  96.62 
 
 
347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  96.62 
 
 
237 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  96.2 
 
 
237 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  94.49 
 
 
347 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  94.49 
 
 
243 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  93.22 
 
 
236 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  82.55 
 
 
342 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  82.98 
 
 
237 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  82.55 
 
 
237 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  82.55 
 
 
237 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  82.55 
 
 
237 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  82.55 
 
 
237 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  82.13 
 
 
237 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  76.82 
 
 
255 aa  374  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  74.25 
 
 
238 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  74.25 
 
 
238 aa  340  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  46.5 
 
 
256 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  46.5 
 
 
256 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  43.85 
 
 
256 aa  188  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  45.28 
 
 
272 aa  178  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  43.86 
 
 
251 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  42.29 
 
 
251 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  42.67 
 
 
258 aa  158  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  43.48 
 
 
223 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  41.78 
 
 
258 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  39.57 
 
 
257 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  42.92 
 
 
244 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  40.34 
 
 
295 aa  148  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  41.82 
 
 
283 aa  145  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  40 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  40.1 
 
 
246 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  35.27 
 
 
311 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  35.37 
 
 
240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  34.16 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  38.3 
 
 
238 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  35.5 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  34.13 
 
 
228 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  33.88 
 
 
254 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  95.1  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  32.03 
 
 
245 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  28.24 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  32.33 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  27.35 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  29.82 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  32.33 
 
 
333 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  31.39 
 
 
245 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  28.79 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  32.85 
 
 
255 aa  85.5  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  29.36 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  30.17 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  29.03 
 
 
256 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  29.47 
 
 
222 aa  82  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  32.41 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  30.96 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  29.96 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  28.28 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  27.62 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  27.82 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  30.67 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  31.94 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  27.9 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  26.94 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  30.77 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  29.96 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  34.03 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  30.43 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  27.51 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  29.2 
 
 
303 aa  72  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  31.41 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  38.53 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  30.05 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  34.93 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  28.33 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  31.12 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  25.4 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  29.6 
 
 
254 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  28.63 
 
 
253 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  41.23 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  24.8 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  29.2 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  26.29 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  27.49 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  28.7 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  27.73 
 
 
324 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  24.15 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  24.17 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  28.91 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  28.79 
 
 
270 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  28.79 
 
 
270 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  28.79 
 
 
270 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  28.1 
 
 
324 aa  62.8  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  28.26 
 
 
249 aa  62.8  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  27.08 
 
 
359 aa  62.4  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  23.43 
 
 
254 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  27.94 
 
 
279 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  26.81 
 
 
223 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  24.29 
 
 
254 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  24.79 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>