141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1681 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  51.97 
 
 		 258 aa  248  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  52.59 
 
 		 258 aa  248  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  53.08 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  46 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  51.02 
 
 		 248 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  51.76 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  51.33 
 
 		 246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  48.33 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  47.06 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  46.15 
 
 		 295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  40.43 
 
 		 236 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  40 
 
 		 347 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  39.57 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  39.57 
 
 		 347 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  39.57 
 
 		 237 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  39.15 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  39.57 
 
 		 237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  39.82 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  39.82 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  39.82 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  39.82 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  39.82 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  39.82 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  39.22 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  39.82 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  38.74 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  36.18 
 
 		 238 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  36.71 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  37.94 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  37.65 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  39.73 
 
 		 272 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  36.73 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  37.4 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  35.32 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  30.97 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  33.77 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  32.65 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  32.37 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  32.78 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  33.03 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  32.34 
 
 		 333 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  34.44 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  29.39 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  26.51 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  33.48 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  28.69 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  26.51 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  32.02 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  31.88 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  31.65 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  30.56 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  30.95 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  30.56 
 
 		 254 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  29.76 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  30.59 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  27.49 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  32.06 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  29.77 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  29.3 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  30.13 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  31.53 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  26.98 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  28.4 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  29.41 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  29.44 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  24.7 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  26.61 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  26.92 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  29.31 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  28.25 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  25.77 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  29.79 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  25.1 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  29.02 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  27.08 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  30.34 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  27.31 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  30.43 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  28.29 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  24.6 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  27.17 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  29.44 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  28.22 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  26 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  29.44 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3796  hypothetical protein  26.25 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  27.46 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3995  hypothetical protein  26.67 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  26.77 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  29.57 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  29.96 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  27.8 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  27.94 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  28.17 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  37.5 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  27.17 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  30.49 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4611  hypothetical protein  26.56 
 
 		 281 aa  52.4  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  27.13 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>