115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_04008 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  100 
 
 		 234 aa  482  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  38.5 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  34.47 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  33.49 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  34.34 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  35.05 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  32.34 
 
 		 255 aa  98.6  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  34.26 
 
 		 253 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  33.51 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  33.8 
 
 		 333 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  34.85 
 
 		 264 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  29.68 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  32.89 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  34.85 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  35.06 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  33.17 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  34.76 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  29.22 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  33.17 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  28.89 
 
 		 308 aa  90.9  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  28.69 
 
 		 252 aa  85.5  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  28.9 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  29.36 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  27.23 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  32.42 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  31.51 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  31.96 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4611  hypothetical protein  29.79 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  31.51 
 
 		 254 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  28.69 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  30.18 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  26.41 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.47 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  29.31 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  28.96 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  27.9 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  28.44 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  27.78 
 
 		 251 aa  72  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  25.82 
 
 		 228 aa  72  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  28.8 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  29.28 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  28.14 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  28.83 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  29.28 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  25.21 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  28.83 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3995  hypothetical protein  27.71 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  28.3 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  26.58 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  28.83 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3796  hypothetical protein  27.27 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0316  hypothetical protein  28.45 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.43 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  25.68 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  28.3 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  28.3 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  28.3 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  28.3 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  29.33 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  28.77 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  27.88 
 
 		 347 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  27.96 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  26.72 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  27.27 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  28.3 
 
 		 342 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  25.37 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.5 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  26.88 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  24.89 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  26.16 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  25.33 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  28.64 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  28.77 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  25 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.72 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  28.77 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  25.24 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  30.28 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1043  hypothetical protein  27.19 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  28.37 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  29.53 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  25.65 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  30.05 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.48 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  29.17 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  23.14 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  24.79 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.24 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  23.21 
 
 		 305 aa  52.4  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  27.18 
 
 		 256 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  27.24 
 
 		 314 aa  51.6  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  27.23 
 
 		 247 aa  51.6  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  30 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  28.69 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  27.75 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  26.91 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  28.51 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  26.09 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  23.05 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>