92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04025 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  467  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0316  hypothetical protein  54.32 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  27.16 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  27.57 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  33.78 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  33.05 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  34.73 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  31.65 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  31.65 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  31.22 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  32.56 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  31.46 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  34.52 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  26.16 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  34.43 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  30.63 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  27.08 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  30.91 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  34.86 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  33.64 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  31.43 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  34.4 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  33.91 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  34.85 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  28.63 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  31.76 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  27.15 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  32.2 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  28.95 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  32.79 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  31.28 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.9 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  31.28 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  30.04 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  32.19 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  30.6 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  28.81 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  30.22 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  30.7 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  28.51 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  31.75 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  31.91 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.6 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  31.06 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  31.49 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  28.19 
 
 		 308 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  28.22 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  31.49 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  26.32 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  30.43 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  30.09 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  27.12 
 
 		 229 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  30.7 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  27.42 
 
 		 255 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  31.1 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  30.17 
 
 		 347 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  29.87 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  30.7 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  26.58 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.74 
 
 		 258 aa  52  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  28.51 
 
 		 237 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  34.44 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  27.08 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  28.96 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.11 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  27.6 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  26.54 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2227  SURF1 family protein  29.22 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.752396  normal  0.0142027 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  27.6 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  27.6 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  27.6 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.56 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.25 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  26.91 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  28.1 
 
 		 342 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  28.57 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  27.61 
 
 		 249 aa  48.5  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  27.39 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  26.58 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  29.96 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  26.25 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  27.24 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  24.23 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  29.87 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  27.63 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  29.61 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  27.27 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  26.09 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  25.74 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  26.64 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3882  hypothetical protein  28.51 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  27.95 
 
 		 246 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>