87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3521 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  527  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  49.8 
 
 		 251 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  45.32 
 
 		 275 aa  228  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  46.12 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  46.12 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  46.12 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  44.96 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  46.3 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  44.66 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  48.98 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  46.56 
 
 		 231 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  46.94 
 
 		 303 aa  205  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3995  hypothetical protein  47.76 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3796  hypothetical protein  46.94 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4611  hypothetical protein  45.45 
 
 		 281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  39.29 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  41.46 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  39.58 
 
 		 236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  28.21 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  28.63 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.97 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  31.27 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.69 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  27.04 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  29.91 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  26.67 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  25.81 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  27.46 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  25.11 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  28.51 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  24.79 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1043  hypothetical protein  26.01 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  26.94 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  27.12 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.52 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  23.95 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  29.03 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  25.5 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  29.6 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  23.95 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  23.53 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  27.43 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.55 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  24.7 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  25.7 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  23.53 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  23.77 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  28.06 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  26.94 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  25.9 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  25.31 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  26.61 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  23.87 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  26.16 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  28.85 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  26.32 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  24.69 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  23.23 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  29.14 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  27.93 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  28.71 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  27.48 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  27.14 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.05 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  24.11 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  22.77 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.38 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  25.1 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  27.31 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  26.54 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  22.77 
 
 		 237 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  26.02 
 
 		 223 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  22.77 
 
 		 237 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  22.77 
 
 		 237 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  22.77 
 
 		 237 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  24.49 
 
 		 237 aa  48.9  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  24.17 
 
 		 223 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  28.71 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  23.56 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  23.75 
 
 		 223 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.37 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  33.33 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  27.73 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  23.71 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  26.77 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  21.88 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>