46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1043 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1043  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  504  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  34.55 
 
 
249 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  29.39 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  25.78 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  32.73 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  29.63 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  30.45 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  26.58 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3995  hypothetical protein  26.34 
 
 
303 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  28.69 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  26.61 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  27.98 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3796  hypothetical protein  26.79 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  26.67 
 
 
303 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  24.8 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  21.48 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  20.39 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  26.55 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  24.28 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4611  hypothetical protein  26.55 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  28.44 
 
 
222 aa  53.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  24.28 
 
 
254 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  23.87 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  23.87 
 
 
254 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  24.43 
 
 
228 aa  52  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  24.66 
 
 
251 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  23.32 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  21.81 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  28.63 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  23.71 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  25.45 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  29.76 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  22.62 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  25.74 
 
 
236 aa  45.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  27.5 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  22.31 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  24.89 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  25.32 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  24.89 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0316  hypothetical protein  30.22 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  27.24 
 
 
333 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  25.75 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  24.89 
 
 
237 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  26.42 
 
 
253 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  24.79 
 
 
347 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  24.47 
 
 
347 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>