171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2227 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  100 
 
 		 347 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  93.66 
 
 		 347 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  77.34 
 
 		 342 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  100 
 
 		 237 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  98.73 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  96.62 
 
 		 237 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  94.58 
 
 		 243 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  94.07 
 
 		 236 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  83.83 
 
 		 237 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  82.55 
 
 		 237 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  82.55 
 
 		 237 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  82.55 
 
 		 237 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  82.13 
 
 		 237 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  82.55 
 
 		 237 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  77.25 
 
 		 255 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  74.57 
 
 		 238 aa  362  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  74.57 
 
 		 238 aa  341  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  47.33 
 
 		 256 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  47.74 
 
 		 256 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  44.26 
 
 		 256 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  45.28 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  44.3 
 
 		 251 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  40.97 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  43.96 
 
 		 223 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  43.11 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  42.22 
 
 		 258 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  39.57 
 
 		 257 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  35.67 
 
 		 295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  41.74 
 
 		 244 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  41.2 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  40.91 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  36.73 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  40 
 
 		 246 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  37.93 
 
 		 238 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  34.16 
 
 		 213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  34.5 
 
 		 240 aa  133  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  35.58 
 
 		 228 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  34.63 
 
 		 240 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  32.82 
 
 		 254 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  29.21 
 
 		 333 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  28.1 
 
 		 243 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  32.77 
 
 		 245 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  31.75 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  27.19 
 
 		 242 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  26.75 
 
 		 242 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  31.39 
 
 		 245 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  32.42 
 
 		 255 aa  86.7  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  28.51 
 
 		 234 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  27.48 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  30.54 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  28.64 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  30.58 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  28.43 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  28.96 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  32.41 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  27.92 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  29.75 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  27.8 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  31.94 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  31.28 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  28.34 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  27.9 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  27.69 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  29.83 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  30.36 
 
 		 247 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  31.94 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  29.22 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  29.31 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  30.52 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  34.9 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  29.95 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  36.11 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  27.8 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  37.61 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  27.78 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  28.03 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  28.83 
 
 		 254 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  28.57 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  25.81 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  41.23 
 
 		 244 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  28.26 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  24.15 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  30.45 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  29.36 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  24.79 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  28.22 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  26.14 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  32.09 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  27.23 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  27.83 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  24.17 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  28.63 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  25.2 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  24.44 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  24.78 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  24.38 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  23.43 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  27.62 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  28.44 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>