100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2713 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  100 
 
 		 249 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  34.62 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1043  hypothetical protein  31.31 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  32.11 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  31.78 
 
 		 234 aa  93.2  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  33.8 
 
 		 234 aa  91.7  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  31.19 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  31.65 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  31.45 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  28.11 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  32.99 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  29.26 
 
 		 308 aa  85.9  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  27.39 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  31.44 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  30.24 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  28 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  27.47 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  27.78 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  30.13 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  28.83 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  26.05 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  26.67 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  29.36 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  30.43 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  26.02 
 
 		 333 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  26.24 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  25.11 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  29.17 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  26.07 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  24.89 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  28.34 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.39 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  27.14 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  24.88 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.33 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  28.63 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  24.44 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  24.52 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  24 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  28.74 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  25.97 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  24.34 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  29.22 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  26.91 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  24.44 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  25.22 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4611  hypothetical protein  26.51 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  24.78 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  24 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  24.55 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  28.02 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  23.53 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3796  hypothetical protein  26.58 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  24.89 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  23.56 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.21 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  27.35 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  21.91 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  25.21 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  24.65 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3995  hypothetical protein  27.03 
 
 		 303 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  25.94 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  22.98 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  23.11 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  23.81 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  23.25 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  23.24 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  25.69 
 
 		 324 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  22.77 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  25.73 
 
 		 229 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  24.03 
 
 		 314 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  22.31 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  27.8 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  21.82 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  26.02 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  24.9 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  25.63 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  25.64 
 
 		 295 aa  46.2  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  25.43 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  23.83 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  24.47 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0316  hypothetical protein  29.93 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  22.37 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  22.92 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  22.37 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  22.37 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  25.76 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  22.37 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  20.95 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  22.22 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  23.44 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  22.37 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  24.69 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  23.98 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  23.77 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  21.92 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  25.21 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  23.33 
 
 		 342 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1399  SurF1 family protein  25 
 
 		 188 aa  42  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  25.23 
 
 		 278 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>