24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1399 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1399  SurF1 family protein  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0920  hypothetical protein  36.17 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0661365  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3882  hypothetical protein  37.77 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  28.5 
 
 		 229 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  26.67 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  28.19 
 
 		 294 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  28.11 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  28.11 
 
 		 223 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  27.97 
 
 		 267 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  28.91 
 
 		 223 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  26.72 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  29.18 
 
 		 301 aa  46.2  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  29.02 
 
 		 246 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  29.81 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  28.7 
 
 		 238 aa  45.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  28.37 
 
 		 278 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  29.02 
 
 		 223 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  27.69 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  44.64 
 
 		 319 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  27.85 
 
 		 256 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  26.32 
 
 		 233 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  35.21 
 
 		 314 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  25.56 
 
 		 246 aa  41.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  25 
 
 		 250 aa  41.2  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>