52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4499 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  100 
 
 		 229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  32.18 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  29.44 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  31.44 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  27.49 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  27.49 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  29.11 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  30.23 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  28.29 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  30.23 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  27.78 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  32.73 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  28.22 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  26.01 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  26.29 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  28 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  29.17 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  27.73 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  25.79 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  27.16 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  27.08 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  27.5 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0920  hypothetical protein  27.68 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0661365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  25 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  26.43 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  27.12 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  30.61 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  30.66 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3882  hypothetical protein  29.39 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1399  SurF1 family protein  28.5 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  29 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  25.3 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  27.88 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  29.58 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  27.03 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  27.93 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  27.12 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  27.1 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  27.13 
 
 		 259 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  27.12 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2227  SURF1 family protein  26.69 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.752396  normal  0.0142027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  27.24 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  24.7 
 
 		 267 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  28.19 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  25 
 
 		 243 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  28.96 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  25.42 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  27.78 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  30.33 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  28.16 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  28.24 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  28.25 
 
 		 250 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>