41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0920 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0920  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0661365  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3882  hypothetical protein  38.05 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1399  SurF1 family protein  36.17 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  29.52 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  28.51 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  24.42 
 
 		 250 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  27.68 
 
 		 229 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  25.11 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  25.88 
 
 		 256 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  30.43 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  23.04 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  31.03 
 
 		 223 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  30 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  26.67 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  29.09 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  25.44 
 
 		 256 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  40.58 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  42.25 
 
 		 237 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  39.13 
 
 		 342 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  42.25 
 
 		 347 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  40.85 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  39.13 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  39.13 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  39.13 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  39.13 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  39.13 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  42.25 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  44.62 
 
 		 347 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  26.58 
 
 		 253 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  30.66 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  26.09 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  25.32 
 
 		 324 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  41.54 
 
 		 243 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  27.6 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  25.62 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  25.82 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  41.54 
 
 		 236 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  23.81 
 
 		 236 aa  42  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  27.27 
 
 		 253 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  23.85 
 
 		 256 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>