65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0752 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  511  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  41.32 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  36.07 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  32.41 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  35.38 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  33.61 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  36.23 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  34.15 
 
 		 286 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  38.53 
 
 		 286 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  40.84 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  32.82 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  31.4 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  31.82 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07660  hypothetical protein  32.51 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66044  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  36.36 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  31.56 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  33.59 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  30.8 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  33.81 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  35.11 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  31.11 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16490  hypothetical protein  36.98 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.888774  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  32.84 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  27.65 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0645  hypothetical protein  30.22 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  0.230839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  29.96 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  32.71 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  27.27 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  32.1 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  34.02 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  31.05 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  34.22 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  27.9 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  27.8 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  25.11 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  28.34 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  28.09 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  28.14 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  29.1 
 
 		 305 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  27.5 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.16 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  31.35 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  27.24 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  30.26 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  27.35 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  28.79 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  33.33 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  23.17 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.27 
 
 		 248 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  27.71 
 
 		 248 aa  45.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  22.55 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  27.31 
 
 		 347 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  26.72 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  26.91 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  27.03 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  26.38 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  22.67 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  28.69 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  28.32 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  30.8 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  30.12 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  32.26 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  27.1 
 
 		 280 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  25.75 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  27.35 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>