129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2566 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  100 
 
 		 304 aa  604  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  35.6 
 
 		 314 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  36.4 
 
 		 264 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  36.95 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  35.64 
 
 		 319 aa  133  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  34.07 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  30.71 
 
 		 303 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  33.74 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  34.25 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  32.67 
 
 		 294 aa  122  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  32.93 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  33.46 
 
 		 256 aa  119  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  31.87 
 
 		 294 aa  119  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  31.98 
 
 		 303 aa  119  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  30.86 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  31.84 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  31.54 
 
 		 271 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  31.9 
 
 		 270 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  31.9 
 
 		 270 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  31.9 
 
 		 270 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  33.06 
 
 		 327 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  34.05 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  34.45 
 
 		 256 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  33.2 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  32.68 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  31.54 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  32.28 
 
 		 286 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  33.77 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  29.76 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  35.8 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  29.3 
 
 		 276 aa  99  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  32.34 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  28.17 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0645  hypothetical protein  32.79 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  0.230839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  30.37 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  30.3 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  26.67 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  28.99 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  30.83 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  34.69 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  30.23 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  27.94 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  30.2 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  30.51 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  26.56 
 
 		 347 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  26.56 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  27.03 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  27.93 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  27.93 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  27.93 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  27.93 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  28 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  26.69 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  27.9 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  27.7 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  29.91 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  25.29 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  26.05 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  26.52 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  27.48 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  26.58 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  27.56 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  26.89 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  28.21 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  27.64 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  27 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.72 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  24.9 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  26.05 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  27.05 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  31.71 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  27.93 
 
 		 237 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  25.63 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  33.88 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  31.4 
 
 		 253 aa  53.9  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  31.4 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  25.21 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  27.23 
 
 		 233 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  25.34 
 
 		 243 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  29.59 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.24 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  28.87 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  25.62 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07660  hypothetical protein  27.04 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66044  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  28.4 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  32.43 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  30.83 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  25.11 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  33.82 
 
 		 241 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  29.91 
 
 		 224 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  32.43 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  25 
 
 		 278 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.26 
 
 		 244 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  21.2 
 
 		 242 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  25.4 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  32.89 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  32.37 
 
 		 272 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  27.72 
 
 		 250 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  28.81 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  28.47 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>