80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3101 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  650    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  51.6 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  47.13 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  50.82 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  48.03 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  50.82 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  50.82 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  49.58 
 
 		 279 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  42.32 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  38.19 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  42.17 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  31.74 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  29.64 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  93.2  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  29.04 
 
 		 288 aa  92.4  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  32.47 
 
 		 272 aa  90.5  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  31.33 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  29.88 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  88.6  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  30.6 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  28.23 
 
 		 303 aa  86.7  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  31.99 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  32.24 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  30.09 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  29.32 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  27.6 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  31.06 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  27.82 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  30.73 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  27.39 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  31.78 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  32.12 
 
 		 265 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  29.1 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  28.5 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  26.72 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  30.62 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  28.29 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  23.18 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  29.77 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  29.48 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  33.94 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  27.24 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  30.24 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  25.64 
 
 		 242 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  30.98 
 
 		 247 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.2 
 
 		 257 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  28.51 
 
 		 278 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.07 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  28.7 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  27.73 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  25.41 
 
 		 245 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  26.21 
 
 		 254 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  29.87 
 
 		 281 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  37.91 
 
 		 293 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07660  hypothetical protein  29.05 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66044  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  31.15 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  22.36 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  27.85 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  25.1 
 
 		 251 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  26.61 
 
 		 253 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  26.75 
 
 		 243 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.53 
 
 		 258 aa  46.6  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  29.95 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  21.96 
 
 		 253 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  26.55 
 
 		 246 aa  45.8  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  22.27 
 
 		 213 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  26.32 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  27.59 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  26.89 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  25 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.29 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  28.74 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  27.39 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  29.86 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.8 
 
 		 248 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  27.59 
 
 		 237 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.67 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  27.16 
 
 		 237 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  24.5 
 
 		 240 aa  42.7  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  30.04 
 
 		 233 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>