49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  31.27 
 
 
298 aa  123  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  36.64 
 
 
279 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  29.21 
 
 
286 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  32.41 
 
 
271 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  31.18 
 
 
276 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  31.42 
 
 
252 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  31.64 
 
 
265 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  33.74 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0645  hypothetical protein  30.74 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  0.230839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  34.77 
 
 
286 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16490  hypothetical protein  30.22 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.888774  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  29.75 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07660  hypothetical protein  34.84 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66044  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  33.96 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  29.74 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  28.63 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  33.07 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  31.7 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  30.77 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  26.05 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  26.85 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  31.87 
 
 
286 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  29.23 
 
 
303 aa  62.8  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  28.1 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  26.61 
 
 
290 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  29.12 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  30.89 
 
 
327 aa  56.2  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  28.17 
 
 
294 aa  55.8  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  35.98 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  28.93 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  24.65 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  28 
 
 
279 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  27.39 
 
 
303 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  26.67 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  26.84 
 
 
292 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  25.81 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  28.16 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  30.49 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  28.98 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  27.72 
 
 
271 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  29.65 
 
 
272 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  25.31 
 
 
245 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  25.3 
 
 
345 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  28.35 
 
 
238 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.37 
 
 
257 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  26.27 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  28.05 
 
 
236 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  27.27 
 
 
237 aa  42.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>