86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3072 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  579  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  37.35 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  32.68 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  32.17 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  31.06 
 
 		 303 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  32.32 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  31.13 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07660  hypothetical protein  33.21 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66044  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  32.82 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  30.33 
 
 		 256 aa  85.9  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  33.77 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  32.85 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  27.96 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  29.37 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  29.52 
 
 		 345 aa  79  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  35.66 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  29.37 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  30 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  29.88 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  31.32 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16490  hypothetical protein  32.13 
 
 		 320 aa  75.5  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.888774  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  33.07 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  27.38 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  27.3 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  29.53 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  27.86 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  28.99 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  30.49 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  30.34 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  27.27 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  27.73 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  29.07 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  28.29 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  31.65 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  29.28 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  29.23 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  27.87 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  27.87 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  28.63 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  27.87 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  27.87 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  27.87 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  26.04 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  29.96 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  27.17 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  27.67 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  28.1 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  27.31 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  27.31 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  27.31 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  27.05 
 
 		 238 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  24.3 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  26.06 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  25.78 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  26.88 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  25.79 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0645  hypothetical protein  24.38 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  0.230839 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  29.06 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  30.87 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  28.74 
 
 		 222 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  28.86 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  30.2 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  25.38 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  25.1 
 
 		 347 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  35.2 
 
 		 228 aa  52.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  32.81 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  25.78 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  27.91 
 
 		 250 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.62 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  34.53 
 
 		 247 aa  49.7  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  28.38 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  27.2 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.94 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  27.53 
 
 		 238 aa  47  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  28.38 
 
 		 236 aa  45.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  28.99 
 
 		 242 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.94 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  30.26 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  27.8 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  27.71 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  27.74 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  28.83 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  26.67 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  34.75 
 
 		 264 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>