56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2871 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  100 
 
 		 298 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  71.48 
 
 		 286 aa  424  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16490  hypothetical protein  43.66 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.888774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  30.23 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  31.27 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  35.16 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  30.98 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  32.68 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  33.65 
 
 		 242 aa  96.3  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  32.16 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  31.2 
 
 		 276 aa  93.2  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  29.12 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  31.22 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0645  hypothetical protein  27.17 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  0.230839 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  32.67 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07660  hypothetical protein  28.74 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66044  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  30.95 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  27.55 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  29.81 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  28.2 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  27.65 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  26.83 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  26.83 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  28.76 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  26.83 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  29.67 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  28.14 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  24.81 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  33.94 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  23.81 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  25.1 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  27.52 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  23.58 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  26.62 
 
 		 256 aa  52.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  26.74 
 
 		 286 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  25.84 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  27.6 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  24.41 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  29.18 
 
 		 345 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  29.07 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  30.34 
 
 		 347 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  24.62 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  31.54 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  30.34 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  30.34 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  31.03 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  30.2 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  23.9 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  24.7 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  27.1 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  29.87 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.12 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0283  hypothetical protein  52.94 
 
 		 180 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  28.57 
 
 		 228 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  29.67 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>