124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0873 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  100 
 
 		 292 aa  580  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  52.45 
 
 		 301 aa  256  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  39.93 
 
 		 280 aa  211  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  44.4 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  44.86 
 
 		 279 aa  208  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  39.24 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  39.24 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  39.24 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  41.6 
 
 		 294 aa  188  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  41.77 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  37.2 
 
 		 345 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  34.25 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  34.98 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  31.54 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  34.29 
 
 		 256 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  31.62 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  30.36 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  34.58 
 
 		 314 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  33.47 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  29.84 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  32.37 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  30.59 
 
 		 256 aa  89.4  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  29.63 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  30.34 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  29.62 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  33.07 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  29.22 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  31.84 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  32 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  28.44 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  26.47 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  27.82 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  29.2 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  26.43 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  32.37 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  27.09 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  32.35 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  30 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  30.95 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  29.65 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  25.83 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  26.34 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  27.5 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  26.58 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  30.18 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  30.18 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  26.12 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  29.12 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  28.51 
 
 		 224 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  26.67 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  28.51 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  27.75 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  26.14 
 
 		 333 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  25.2 
 
 		 247 aa  53.5  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  27.27 
 
 		 245 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0645  hypothetical protein  28.41 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  0.230839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  32.14 
 
 		 250 aa  52.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  25.33 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  24.15 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  31.09 
 
 		 359 aa  51.6  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  27.27 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  30.77 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  23.73 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  25.33 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  30.7 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  25.54 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  32.46 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  25.1 
 
 		 347 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  26.84 
 
 		 306 aa  49.3  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  30 
 
 		 283 aa  49.3  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.77 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  29.83 
 
 		 261 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  27.27 
 
 		 250 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  20.18 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  26.37 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  22.86 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  24.4 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  24.28 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  26.37 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  21.68 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  31.93 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  27.47 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  27.43 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  27.43 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  23.91 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  25.99 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  28.76 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  26.78 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  25.85 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  25.86 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  29.84 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.39 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  33.66 
 
 		 220 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  27.73 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  37.21 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  26.79 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  25.85 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  25.79 
 
 		 222 aa  45.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  25.48 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>