60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0645 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0645  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  616  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  0.230839 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  52.01 
 
 		 279 aa  252  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  44.36 
 
 		 283 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  43.13 
 
 		 286 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  36.33 
 
 		 242 aa  99  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  31.45 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  30.08 
 
 		 276 aa  95.9  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  31.91 
 
 		 270 aa  93.6  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  32.79 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  29.86 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  30.62 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  29.37 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07660  hypothetical protein  33.57 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66044  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  28.14 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  30.88 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  28.15 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  27.08 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  30.51 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16490  hypothetical protein  31.37 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.888774  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  26.89 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.52 
 
 		 251 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  28.68 
 
 		 256 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  30.71 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  27.54 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  29.08 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  28.52 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  24.72 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  30.37 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  28.79 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  26.24 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  26.12 
 
 		 237 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  26.53 
 
 		 237 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  25.87 
 
 		 238 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  25.71 
 
 		 342 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  25.71 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  25.71 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  25.71 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  25.71 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  28.69 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  27.16 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  24.51 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  26.45 
 
 		 238 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  25.38 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  26.59 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  25.32 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  25 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  26.25 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  32.65 
 
 		 234 aa  46.2  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  26.27 
 
 		 237 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  26.27 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  25.75 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  24.9 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  26.48 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  28.09 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  28.91 
 
 		 224 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  27.27 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  24.38 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  25.88 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  25.49 
 
 		 237 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  23.89 
 
 		 245 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>