86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2575 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  541  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  54.02 
 
 		 279 aa  206  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0645  hypothetical protein  43.13 
 
 		 311 aa  155  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  0.230839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  45.41 
 
 		 242 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  44.58 
 
 		 283 aa  135  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  40.3 
 
 		 252 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  39.84 
 
 		 276 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  39.26 
 
 		 270 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  34.6 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  34.88 
 
 		 265 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  39.46 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  32.68 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  35.48 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  34.07 
 
 		 256 aa  93.6  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  29.89 
 
 		 298 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  34.51 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  32.94 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  34.02 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07660  hypothetical protein  35.24 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66044  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  33.2 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  34.02 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  36.04 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  32.67 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  33.59 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  34.45 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16490  hypothetical protein  34.92 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.888774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  33.47 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  33.92 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  37.4 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  32.23 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  40 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  30.04 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  38.4 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  36.97 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  30.12 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  31.68 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  28.95 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  29.92 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  35.71 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  29.67 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  28.05 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  31.97 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  31.08 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  31.97 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  31.97 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  29.32 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  30.47 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  29.67 
 
 		 236 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  28.22 
 
 		 342 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  30.3 
 
 		 271 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  27.04 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  30.74 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  27.04 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  27.04 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  27.04 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  36.02 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  28.7 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  36.42 
 
 		 248 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  29.27 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  30.83 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  28.14 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  26.61 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  38.81 
 
 		 251 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  34.25 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  35.17 
 
 		 246 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  37.41 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  26.23 
 
 		 238 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.72 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  30.47 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  26.75 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  28.05 
 
 		 347 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  29.53 
 
 		 327 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  27.43 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  27.64 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  28.22 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  39.04 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  29.28 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  31.42 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  36.51 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  31.12 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  32.37 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  30.68 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  28.63 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  34.38 
 
 		 254 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  26.75 
 
 		 228 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>