84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4197 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4197  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  254  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  35.59 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  38.98 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  37.29 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  40.43 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  36.44 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  38.46 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  35.96 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  31.2 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  35.48 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  29.82 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  31.91 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  34.78 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0606  hypothetical protein  35.8 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.090863  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  34.41 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  32.46 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  30.84 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  37.78 
 
 		 161 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  37.68 
 
 		 460 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  37.78 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  41.07 
 
 		 461 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  31.68 
 
 		 460 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3797  hypothetical protein  32.73 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  30.88 
 
 		 445 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5129  hypothetical protein  31.82 
 
 		 170 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  35.82 
 
 		 460 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4193  type II and III secretion system protein  40.26 
 
 		 545 aa  50.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  39.44 
 
 		 574 aa  50.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3496  hypothetical protein  35.62 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  33.33 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  37.29 
 
 		 486 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  28.33 
 
 		 487 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  32.76 
 
 		 408 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  39.24 
 
 		 482 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  39.24 
 
 		 482 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  39.24 
 
 		 482 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  39.24 
 
 		 482 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  39.24 
 
 		 482 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  39.24 
 
 		 482 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  34.38 
 
 		 679 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  37.31 
 
 		 478 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  32.81 
 
 		 690 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  38.89 
 
 		 492 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 690 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  32.81 
 
 		 690 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  39.39 
 
 		 526 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0800  type II and III secretion system protein  32.14 
 
 		 510 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  35.94 
 
 		 656 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  30.19 
 
 		 416 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  36.36 
 
 		 663 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  34.38 
 
 		 652 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  29.63 
 
 		 493 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 497 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  34.38 
 
 		 657 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  26.28 
 
 		 486 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  35.9 
 
 		 493 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  26.25 
 
 		 520 aa  41.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  34.07 
 
 		 484 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  25.84 
 
 		 466 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  30.95 
 
 		 501 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  31.25 
 
 		 634 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  31.08 
 
 		 474 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  32.93 
 
 		 496 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  32.81 
 
 		 642 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  27.85 
 
 		 479 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  32.81 
 
 		 646 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  32.81 
 
 		 642 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  30.38 
 
 		 497 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  32.84 
 
 		 502 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  35.19 
 
 		 466 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  32.81 
 
 		 603 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  35.29 
 
 		 491 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  31.25 
 
 		 633 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 517 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  32.81 
 
 		 620 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  30.38 
 
 		 539 aa  40  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  30 
 
 		 461 aa  40  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  27.78 
 
 		 494 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06196  Flp pilus assembly protein, secretin CapC  31.58 
 
 		 456 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  38.2 
 
 		 469 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  30.56 
 
 		 461 aa  40  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  30 
 
 		 461 aa  40  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  28.71 
 
 		 546 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.78564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>