33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0305 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  328  3e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  87.42 
 
 		 161 aa  288  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  65.36 
 
 		 161 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  72.79 
 
 		 165 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  61.73 
 
 		 164 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  68.7 
 
 		 145 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  47.62 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  55.93 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  53.98 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  55.08 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3496  hypothetical protein  52.68 
 
 		 164 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  38.93 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  35.48 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5129  hypothetical protein  39.25 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  36.3 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0606  hypothetical protein  30.57 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.090863  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  37.63 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4197  hypothetical protein  35.59 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  32.71 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  31.9 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  30.58 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  30.51 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3781  hypothetical protein  35.48 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3797  hypothetical protein  34.78 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  45.61 
 
 		 574 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  29.76 
 
 		 478 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 486 aa  43.9  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 461 aa  42  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  30.95 
 
 		 483 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  30.38 
 
 		 478 aa  41.2  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  54.17 
 
 		 270 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  30.12 
 
 		 474 aa  40.8  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>