46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3781 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3781  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  37.93 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  33.6 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  34.78 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3797  hypothetical protein  31.75 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  34.15 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  34.26 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  34.26 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  35.48 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  35.42 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  30.33 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  35 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  31.58 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  38.04 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  34.69 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  34.34 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3496  hypothetical protein  32.69 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  33.33 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  33.33 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  28.7 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  45.9 
 
 		 574 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  32.41 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  34.38 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  31.65 
 
 		 461 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  36.59 
 
 		 443 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  34.62 
 
 		 443 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0606  hypothetical protein  29.52 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.090863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  34.62 
 
 		 443 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  34.62 
 
 		 443 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  31.82 
 
 		 461 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  38.1 
 
 		 486 aa  44.7  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5129  hypothetical protein  37.04 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  30.08 
 
 		 441 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0800  type II and III secretion system protein  31.48 
 
 		 510 aa  43.9  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  43.86 
 
 		 454 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  33.71 
 
 		 441 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  40.35 
 
 		 468 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  33.71 
 
 		 441 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  33.71 
 
 		 441 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  33.71 
 
 		 441 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  27.27 
 
 		 487 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  29.31 
 
 		 483 aa  41.2  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  27.59 
 
 		 480 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  32.18 
 
 		 475 aa  41.2  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  36.67 
 
 		 517 aa  41.2  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  29.89 
 
 		 478 aa  41.2  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>