60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4096 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  276  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  59.13 
 
 		 139 aa  136  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  45.76 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  47.06 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  43.22 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  46.61 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  38.79 
 
 		 172 aa  90.1  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  39.09 
 
 		 163 aa  84.3  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  39.29 
 
 		 164 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  37.72 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  40.74 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  35.4 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  41.94 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  38.71 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  36.44 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  37.61 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  36.97 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3496  hypothetical protein  36.08 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  37.11 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  36.08 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3797  hypothetical protein  34.59 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4197  hypothetical protein  34.21 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0606  hypothetical protein  30.77 
 
 		 167 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.090863  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3781  hypothetical protein  28.36 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5129  hypothetical protein  34.07 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  35.53 
 
 		 512 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  32.91 
 
 		 525 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  31.46 
 
 		 460 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  32.47 
 
 		 524 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  31.03 
 
 		 460 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  35.37 
 
 		 502 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  32.93 
 
 		 493 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  31.58 
 
 		 460 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  31.34 
 
 		 486 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  24.53 
 
 		 461 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  34.15 
 
 		 502 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 486 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  30.93 
 
 		 501 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  32.53 
 
 		 492 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  28.95 
 
 		 499 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  30.11 
 
 		 386 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  35.44 
 
 		 480 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  28.95 
 
 		 499 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  33.73 
 
 		 482 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  33.73 
 
 		 482 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0800  type II and III secretion system protein  25.27 
 
 		 510 aa  42  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  31.88 
 
 		 474 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  32.58 
 
 		 491 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  33.73 
 
 		 482 aa  42  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  33.73 
 
 		 482 aa  42  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  33.73 
 
 		 482 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  33.73 
 
 		 482 aa  42  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  22.55 
 
 		 478 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 494 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  38.33 
 
 		 499 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  30.77 
 
 		 480 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  38.33 
 
 		 546 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.78564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  34.94 
 
 		 492 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  32.56 
 
 		 507 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  26.39 
 
 		 574 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>