30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2823 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  319  8e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  89.68 
 
 		 158 aa  229  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  72.44 
 
 		 160 aa  192  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  63.29 
 
 		 159 aa  193  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  72.13 
 
 		 160 aa  188  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3496  hypothetical protein  66.12 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  50.98 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  48.99 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  53.33 
 
 		 164 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  54.87 
 
 		 145 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  52.34 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  55.93 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5129  hypothetical protein  40.15 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0606  hypothetical protein  35.19 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.090863  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  36.43 
 
 		 172 aa  85.1  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  38.68 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  34.92 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  37.86 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  32.81 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  34.93 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  32.63 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4197  hypothetical protein  37.07 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3781  hypothetical protein  34.69 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3797  hypothetical protein  30.71 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  36 
 
 		 574 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  33.77 
 
 		 478 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  37.1 
 
 		 461 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  35.48 
 
 		 486 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0800  type II and III secretion system protein  31.33 
 
 		 510 aa  40.8  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>