30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7025 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  293  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  72.31 
 
 		 165 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  65.47 
 
 		 161 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  67.63 
 
 		 161 aa  191  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  62.86 
 
 		 164 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  64.93 
 
 		 163 aa  184  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  54.55 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  50.41 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  47.69 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  48.82 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  48.39 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3496  hypothetical protein  48.31 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  36.67 
 
 		 172 aa  88.6  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  41.94 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  34.51 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  36.54 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0606  hypothetical protein  30.77 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.090863  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5129  hypothetical protein  31.88 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  33.33 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  34.29 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4197  hypothetical protein  40.43 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  36.54 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3797  hypothetical protein  34.96 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3781  hypothetical protein  38.04 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  50.91 
 
 		 574 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  62.5 
 
 		 270 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  28.12 
 
 		 478 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  38.81 
 
 		 496 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  34.43 
 
 		 486 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>