54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4472 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  100 
 
 		 136 aa  275  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  96.32 
 
 		 136 aa  268  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  77.68 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  73.33 
 
 		 159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  42.37 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  46.94 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  34.78 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  37.74 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3496  hypothetical protein  41.58 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  38.78 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  39.22 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  34.58 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  33.93 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0606  hypothetical protein  38.71 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.090863  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  31.03 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  30.91 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  28.69 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5129  hypothetical protein  34.38 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  35.64 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  38.89 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  36.56 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4197  hypothetical protein  36 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3781  hypothetical protein  34.38 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3797  hypothetical protein  36.52 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  35.71 
 
 		 461 aa  51.6  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  32.65 
 
 		 496 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  38.6 
 
 		 486 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  32.98 
 
 		 679 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  31.63 
 
 		 690 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  31.63 
 
 		 690 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  38.03 
 
 		 574 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  31.4 
 
 		 461 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  31.82 
 
 		 478 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  31.4 
 
 		 461 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  35.44 
 
 		 690 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  31.4 
 
 		 461 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  32.22 
 
 		 466 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  30 
 
 		 460 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  35 
 
 		 517 aa  43.5  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  37.84 
 
 		 474 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  31.52 
 
 		 497 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 460 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2580  hypothetical protein  26.55 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.948349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0800  type II and III secretion system protein  29.85 
 
 		 510 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  29.73 
 
 		 663 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 460 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  34.38 
 
 		 483 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  26.23 
 
 		 445 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  30.95 
 
 		 492 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  31.43 
 
 		 656 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  31.43 
 
 		 657 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  27.4 
 
 		 479 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  30 
 
 		 652 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>