34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2404 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  89.38 
 
 		 160 aa  265  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  82.5 
 
 		 159 aa  260  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  76.42 
 
 		 158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  72.44 
 
 		 161 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3496  hypothetical protein  71.67 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  53.33 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  52 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  46.72 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  43.95 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  44.16 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  50.89 
 
 		 145 aa  127  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  36.03 
 
 		 172 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5129  hypothetical protein  35.37 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0606  hypothetical protein  35.2 
 
 		 167 aa  88.6  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.090863  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  34.92 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  40 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  37.11 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  33.08 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  30.43 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  38.78 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  34.06 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4197  hypothetical protein  35.48 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3781  hypothetical protein  33.09 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  32.58 
 
 		 496 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3797  hypothetical protein  26.04 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  38.81 
 
 		 574 aa  45.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  33.73 
 
 		 460 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  36.07 
 
 		 486 aa  42.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  40 
 
 		 461 aa  42.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  27.96 
 
 		 483 aa  40.8  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  30.53 
 
 		 492 aa  40.8  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  27.55 
 
 		 502 aa  40.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  27.55 
 
 		 499 aa  40.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>