30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3708 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  329  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  66.87 
 
 		 164 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  69.54 
 
 		 161 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  72.99 
 
 		 161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  72.79 
 
 		 163 aa  207  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  76.52 
 
 		 145 aa  190  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  54.92 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  45.1 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  52.89 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  50.41 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  49.18 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3496  hypothetical protein  46.28 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  36.64 
 
 		 172 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  37.4 
 
 		 152 aa  87.8  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  35.34 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  40.86 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  28.69 
 
 		 136 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  27.91 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  29.37 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3781  hypothetical protein  37.93 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5129  hypothetical protein  30 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0606  hypothetical protein  29.2 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.090863  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4197  hypothetical protein  35.96 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  28.69 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3797  hypothetical protein  32.46 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  49.09 
 
 		 574 aa  47.8  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  62.5 
 
 		 270 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  27.52 
 
 		 493 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  33.33 
 
 		 483 aa  41.2  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  23.62 
 
 		 478 aa  40.8  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>