37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0606 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0606  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  327  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.090863  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5129  hypothetical protein  53.95 
 
 		 170 aa  164  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  35.97 
 
 		 161 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  35.2 
 
 		 160 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  35.9 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3496  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  35.9 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  37.07 
 
 		 158 aa  84  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  30.57 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  33.61 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  32.46 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  30.63 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  37.63 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  30.36 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  30.83 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  35.48 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  29.2 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  33.33 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  38.71 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  32.52 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  33.72 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4197  hypothetical protein  35.8 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  32.41 
 
 		 499 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  33.01 
 
 		 499 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3781  hypothetical protein  29.52 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  34.09 
 
 		 502 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  38.16 
 
 		 516 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  35.29 
 
 		 502 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  43.75 
 
 		 690 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  43.75 
 
 		 690 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  35.29 
 
 		 499 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  37.93 
 
 		 679 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 690 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  27.35 
 
 		 507 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  32.1 
 
 		 633 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  32.5 
 
 		 663 aa  40.8  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>