63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0224 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  100 
 
 		 159 aa  327  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  73.33 
 
 		 136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  63.91 
 
 		 140 aa  167  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  73.73 
 
 		 136 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  44.03 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  51.04 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  34.21 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  38.61 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3496  hypothetical protein  37.07 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  30.28 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  33.82 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  29.01 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  27.21 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  34.34 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  32.41 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  29.46 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  30.83 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0606  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.090863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  31.96 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5129  hypothetical protein  32.29 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4197  hypothetical protein  30.84 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3781  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3797  hypothetical protein  35.4 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 486 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  35.71 
 
 		 461 aa  51.2  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  31.91 
 
 		 482 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  31.91 
 
 		 482 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  31.91 
 
 		 482 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  31.18 
 
 		 482 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  25.71 
 
 		 445 aa  47.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  31.18 
 
 		 482 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  31.18 
 
 		 482 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  26.53 
 
 		 460 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  37.5 
 
 		 679 aa  47.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  31.25 
 
 		 484 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  37.29 
 
 		 574 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  29.63 
 
 		 496 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  40 
 
 		 690 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  40 
 
 		 690 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  40 
 
 		 690 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  31.67 
 
 		 517 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  25.51 
 
 		 460 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 497 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  25.26 
 
 		 460 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0800  type II and III secretion system protein  32.14 
 
 		 510 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  29.21 
 
 		 492 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  34.48 
 
 		 416 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  31.4 
 
 		 461 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  31.4 
 
 		 461 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  36.07 
 
 		 483 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  31.4 
 
 		 461 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  34.55 
 
 		 620 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  28.77 
 
 		 479 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  28.09 
 
 		 493 aa  42.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  34.55 
 
 		 663 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 478 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  28.75 
 
 		 386 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  24.04 
 
 		 475 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 656 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  34.55 
 
 		 657 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  34.55 
 
 		 652 aa  40.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>