55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4184 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  100 
 
 		 136 aa  276  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  96.32 
 
 		 136 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  76.79 
 
 		 140 aa  183  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  73.33 
 
 		 159 aa  181  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  43.22 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  46.94 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  34.78 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  38.68 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  38.78 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3496  hypothetical protein  43.16 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  35.51 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  39.22 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  33.93 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  31.9 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0606  hypothetical protein  37.63 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.090863  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  31.82 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  36.56 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  36.63 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  28.69 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  40.2 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5129  hypothetical protein  34.38 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4197  hypothetical protein  32.46 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3797  hypothetical protein  37.14 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3781  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  34.29 
 
 		 461 aa  51.6  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  31.63 
 
 		 496 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  38.6 
 
 		 486 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  39.44 
 
 		 574 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0800  type II and III secretion system protein  31.43 
 
 		 510 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  31.91 
 
 		 679 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2580  hypothetical protein  26.55 
 
 		 217 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.948349  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  35 
 
 		 517 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  30.61 
 
 		 690 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  31.82 
 
 		 478 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 690 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  31.4 
 
 		 461 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  31.4 
 
 		 461 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  31.4 
 
 		 461 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  28.77 
 
 		 479 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  27.87 
 
 		 445 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  34.25 
 
 		 474 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  35.94 
 
 		 483 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  34.18 
 
 		 690 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  30.1 
 
 		 497 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  28.83 
 
 		 663 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 460 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 460 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  30.95 
 
 		 492 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  31.11 
 
 		 466 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 460 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0749  type II and III secretion system protein  29 
 
 		 436 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  27.93 
 
 		 620 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  30.99 
 
 		 633 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06196  Flp pilus assembly protein, secretin CapC  31.67 
 
 		 456 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>